Proética tiene tres objetivos institucionales:

1. Analizar, identificar y exponer los principales problemas de corrupción en los ámbitos donde interviene.
2. Incidir en la toma de decisiones públicas para combatir la corrupción, mediante la comunicación de propuestas basadas en las investigaciones realizadas.
3. Desarrollar las capacidades institucionales de entidades del estado y organizaciones de la sociedad civil para luchar contra la corrupción, transfiriendole el conocimiento acumulado y las experiencias exitosas.